如何快速从转录组数据中筛选目标基因!

网上有关“如何快速从转录组数据中筛选目标基因!”话题很是火热,小编也是针对如何快速从转录组数据中筛选目标基因!寻找了一些与之相关的一些信息进行分析,如果能碰巧解决你现在面临的问...

网上有关“如何快速从转录组数据中筛选目标基因!”话题很是火热,小编也是针对如何快速从转录组数据中筛选目标基因!寻找了一些与之相关的一些信息进行分析,如果能碰巧解决你现在面临的问题,希望能够帮助到您。

如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据?这是困扰大多数老师的一个难题!

我以一个excel的简单函数为例,演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣的基因等信息。

函数的名称是 VLOOKUP函数 ,该函数是Excel表中的一个纵向查找函数,学会该函数之后, 可以方便我们从所有基因的结果中筛选我们关心的基因相关信息,比如:基因的长度、基因在样品中的表达量、基因的注释等等信息 。

VLOOKUP函数需要输入4个值:

1、要查找的值,比如:基因的ID;

2、需要查找的区域;

3、区域中包含返回值的列号,也就是找到相关值之后返回第几列的信息;

4、精确匹配或者近似匹配,一般我们选择精确匹配。精确匹配采用0/FALSE、近似匹配采用1/TRUE。

一般来说,我们做完转录组测序,都会有一个总表,表里有所有基因的ID、长度、表达量、差异倍数、注释信息等等,表格很大,内容很多。

如果我们想提取某些差异基因的基因长度信息,那么我们该如何操作呢?

我们需要在需要提取长度信息的差异基因表中加上一列gene_length列。

然后插入VLOOKUP函数,按要求输入4个参数,点击确定即可。

以上是利用基因ID在总表中查找一列信息,比较简单。如果我们想查找多列信息该如何操作呢?

方法相似,我们可以在总表中插入deg_gene列,然后去差异基因表中查找基因ID即可,具体操作如下:

到这里,一个简单的Excel表筛选基因信息的方法就介绍完了,实际上在公司给出转录组标准分析之后,很多个性化都可以由自己解决,您需要的仅仅是高手领进门!

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关于“如何快速从转录组数据中筛选目标基因!”这个话题的介绍,今天小编就给大家分享完了,如果对你有所帮助请保持对本站的关注!

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  • 春绿
    春绿 2025年02月17日

    我是氢时代的签约作者“春绿”!

  • 春绿
    春绿 2025年02月17日

    希望本篇文章《如何快速从转录组数据中筛选目标基因!》能对你有所帮助!

  • 春绿
    春绿 2025年02月17日

    本站[氢时代]内容主要涵盖:国足,欧洲杯,世界杯,篮球,欧冠,亚冠,英超,足球,综合体育

  • 春绿
    春绿 2025年02月17日

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